R言語入門編

届きました。。

		The R Tips―データ解析環境Rの基本技・グラフィックス活用集 著者： 舟尾 暢男 (編集)
		Rの基礎とプログラミング技法 著者： U.リゲス (著), 石田 基広 (翻訳)

R言語の参照URLは以下。

Rとは?何ができるか?とか → http://aoki2.si.gunma-u.ac.jp/R/link.html
R-tips プログラミング→ http://cse.naro.affrc.go.jp/takezawa/r-tips/r.html
RjpWiki → http://www.okada.jp.org/RWiki/


関心をもったきっかけは、「多変量解析とグラフィカルな統計をしてみたい＆微分方程式を解く言語に触れたい」の2点に尽きます。

解いてみたい関数は下記書籍にあるので近々に挑戦してみます。

　「複素ニューラルネットワーク」 廣瀬　明　（サイエンス社、　SGCライブラリ　38）

複素ニューラルネットワークのネタはこちら。。

さくらサーバとSQLite

さくらサーバ(FreeBSD 6.x)にSQlite3.5.5のインストール、無事に入ることを祈りつつ。

参照サイトのSQLiteはバージョンが異なるのでそこを修正しつつインストール完了。

% cd $HOME/src
でディレクトリ移動しておき

% wget http://www.sqlite.org/sqlite-3.5.5.tar.gz

% tar xzvf sqlite-3.5.5.tar.gz

$ cd sqlite-3.5.5
で、ファイルがあることを確認。。

$ ./configure --prefix=$HOME/usr --disable-dynamic

$ make

で

sed -e s/--VERS--/3.5.5/ ./src/sqlite.h.in | sed -e s/--VERSION-NUMBER--/3005005/ >sqlite3.h　gcc -g -O2 -o lemon ./tool/lemon.c‥

とか出てきて

$ make install
で、

See any operating system documentation about shared libraries for
more information, such as the ld(1) and ld.so(8) manual pages.

とか表示されて、サーバのディレクトリの中に納まっていれば完了。
起動は/home/(ユーザ名)/src/sqlite-3.5.5まで移動後、コマンドで"sqlite3"の入力でOK。
(※ コマンドの都合上SQLiteを停止するには「.quit」なのですね。。「.」忘れず、と。。)

いやはや先人に感謝です。

さくらサーバとCatalyst

Paggerが入ったので、動作確認と併せてCatalystを仕込む。

有用な参考情報はここ。

単純にモジュール入れるだけでは、動作しないとのことでした。

下準備

アプリケーションの場所はuserディレクトリのwww以下でないところに作成。

• CPANモジュールは~/perl/lib(/home/username/perl/lib)がインストール先
• アプリケーションは~/(アプリ名)(/home/username/(アプリ名))に作成

【手順】

1. CPANからTASK：：Catalyst入れる。(所要時間はおよそ30分と長め)
   
   
2. DB作成(今回は"さくらサーバ"に既存のMySQL利用)
   
   
3. Catalystのアプリ作成
   (→テストの為、簡単なHello表示されるもの)
   3-1　ワークディレクトリで catalyst.pl　(アプリ名)　でアプリ作成　
   3-2　scriptディレクトリにて script/(アプリ名)_server.pl　でアプリ起動＆停止はCtrl+C
   
   
4. ~/www周辺のファイル設定(ディレクトリいじり＆Apacheへのアクセス)
   
   
5. http://www(登録ホスト名参照).sakura.ne.jp:3000/でWebアプリが表示されればOK
   

ほとんど参考ページ通りだったので、その差異だけ。。

ページには

• script/myApp_cgi.plの書き換え

• シンボリックリンクの作成

• .htaccessの作成

の手順があったのが、始めの(アプリ名)_cgi.plのファイルはいじらなくてもエラー出ませんでした。

シンボリックリンクがあればhttp://(username).sakura.ne.jp/に行った際、ディレクトリ構造の中に~/www/script　ができる。

.htaccessファイルを作成して、FTPで~/www/下へアップ。(大・小文字は気をつける)


「.htaccessファイル」

AddHandler cgi-script .pl

RewriteEngine On
RewriteCond %{REQUEST_URI} !^/Hello/?script/hello_cgi.pl
RewriteRule ^hello/(.*)$ script/hello_cgi.pl/$1 [PT,L]

以上、http://www(登録ホスト名参照).sakura.ne.jp:3000/へ遷移後、「Hello on Catalyst 5.7012」のページが表示されたらCatalyst起動確認完了。

さくらサーバとPlaggerインストール

初めてのFreeBSD、、ちなみに"さくらのレンタルサーバ"(月々￥500、１GB、その他サービス込み)はお得と思う。

で、Plaggerのインストール。

これを済ませておけば、後々遠隔(cronの機能とかで)自動RSS or メール配信が可能になるから。

まずはここからスタート。


【手順】
さくらサーバのユーザ領域では、やりたい放題できないようだが、やり方は迂回してで何通りかあるらしい(subversion とかBSDPANなど？他の情報はこちら)。


自分の場合は慣れたCPAN経由で実行。

1. MyConfig.pmの修正

2. CPANのインストール　

3. Plaggerのインストール

先に挙げたサイト通りにつまづくところ(※)もありで、半日くらいかかった。


【※自分の嵌ったポイント】

・FreeBSDは"UTF-8"では起動時にコマンドエラーが発生した、"EUC"で修正対象ファイルを上書きしたら治った。

下記は参照URLを見ながら順に解決。
・ Template が入らない
・ DateTime::TimeZone、DateTime::Format::Mail が入らない
・ Encode::Detect が入らない

「Module::Build が古いのが原因でオプションが認識されない」の部分は巧妙で、ここで先に"Build.PL"を自力インストールしておくと、つまづいた箇所が解決することがあった。
(今回はXML::Feedの一部でインストールできなかったところが、この過程ですっきりした。)


・全モジュールのインストール後、Plagger -v でplaggerの起動を確認したら、「Not Found Command」が表示された。

→これは調べても検索されず、ローカルで起動させたように強引に"plagger.bat","plagger.pm"をコピーして適当なディレクトリに収めたら、正常に反応するようになった。
ただ、そのままコピペではなくPerlのバージョンにあわせた修正を施すのも必要だった。

"plagger.bat"
/home/(user)/local/bin

"plagger.pm"
/home/(user)/local/lib/perl5/Plaggerへ
以上で、plagger -v でバージョン表示OKでした。


～追記～


"plagger.pm"のエラーに

Can't locate Plagger.pm in @INC (@INC contains: /home/～

とか

Can't find package from /home/(ユーザ名)/local/lib/perl5/Plagger/Plugin/Plagger.pm at /home/(ユーザ名)/local/lib/perl5/Plagger.pm line 180.

とか出たら環境変数の設定（参照）、plagger.pmファイルの格納アドレス、plagger.pmファイルの文字コード(自分の場合はEUC-JP)を突き合わせてみる必要がありました。
（自分もplagger.pmファイルは/home/(ユーザ名)/local/lib/perl5　へ置くことに）

環境変数を修正後は

source ~/.cshrcで環境変数読み込み、Plaggerの起動確認をします。

Oracle9i インストール備忘録

XAMPPの障害でMySQL抜こうとしたら、システムに張り付いて外れなかった記憶が甦る。。

　以下、Oracle 9i　インストール備忘録。9iな訳は都合です。。

既に10gも落ち着いているこのご時勢。
探せば情報源は沢山転がっているので、肝のところのみ。

1. ダウンロードしたフォルダをC: 直下に移動。デスクトップ上ではインストールウィザード起動しないこと。
   
2. 1.のinstallフォルダ内"setup.exe"を実行する。
3. デフォルトのまま次へ～で平気。ただ、一度失敗して再インストールするとホーム名が違っているので注意。
   
   
4. インストール後、「コンピュータ」右クリック→「サービスとアプリケーション」→「サービス」で、"Oracle"にまつわる全てのサービスメニューを停止しておくこと。(ここで停止せずにパッチあてようとするとエラーが頻発し、"設定失敗"と表示される。)
5. C:直下に移動しておいたOracle patchセットのinstallフォルダ内の"setup.exe"を実行。
6. あとは次へ～で終了、付随のアプリが正常起動することを確認。

一度インストールに失敗して、の話しもあったので、アンインストールについても下記にて列挙。

• アンインストールの順番は「①インストール時同様、Oracle系統のサービスを全停止→②ウィザードからファイル群を削除→③C: や周辺に(userのtmpフォルダ内に隠れてたりする)あるOracle関連のフォルダを削除→④「ファイル名を指定、で"regedit"を入力して開いたレジストリをからOracle関連キーを削除(ただしこれは厳重に注意)」」
  
  
• ②では、パッチあてたならパッチフォルダからUniversal Installerウィザードを起動して削除すること。
• ④は②完了時点で大体消えているOracleキーのファイルの残りを消していくもの。

という感じでした。。

一度インストール失敗してて、そこから挽回しようと画策してたら時間を浪費してしまった。
TNSのエラーとかの知識が身についた分、無駄でなかったけど。